La directive ScriptAlias permet d'indiquer au serveur où se trouvent les scripts CGI. La syntaxe est
ScriptAlias cheminCGI répertoireCGIoù cheminCGI indique le chemin utilisé dans l'url pour atteindre les scripts CGI et répertoireCGI indique le répertoire où se trouvent les scripts CGI. Ainsi, la requête http://serveur/cheminCGI/script fera s'exécuter le script répertoireCGI/script.
L'option ExecCGI permet d'autoriser l'exécution de scripts CGI.