Pierre Marquis a obtenu un doctorat d'Université, spécialité informatique, à l' Université de Nancy I en 1991. La même année, il a obtenu un poste de maître de conférences à l'UFR de mathématiques et informatique de l'Université de Nancy II . Jusqu'en 1996, il a été affilié au CRIN-CNRS / INRIA-Lorraine (maintenant LORIA ). Pierre Marquis a obtenu sa mutation à l' Université d'Artois  en 1996, où il a soutenu une habilitation à diriger des recherches en 1997 et obtenu un poste de professeur des Universités en 1998.